В то время как Джилл Валентайн пытается выбраться из мертвого Раккун-Сити, «Амбрелла» посылает в город несколько отрядов наемников, которые даже не подозревают что посланы для нового эксперимента, а вовсе не для спасения гражданских. Молодой член одного из отрядов Карлос Оливейра получает предупреждение от загадочного Трента о том, что не все кажется таким как есть и что их задание может быть намного опасней чем он думает, Но Карлос даже не представляет насколько..

Ребекка, Клер, Леон, Дэвид и Джон летят в Европу узнать что случилось с Крисом, Джилл и Барри, которые полетели чтобы пробраться в главный офис «Амбреллы» и уже долго не выходили на связь. Но на их пути опять появляется загадочный Трент, который дает им наводку на лабораторию «Амбреллы» которая должна быть запущена через несколько недель и не имеет особой охраны. Воспользовавшись данными Трента, они отправляются за доказательствами против «Амбреллы» в очередную их лабораторию... очередное подземелье...

Молодой Леон Кеннеди отправляется в Раккун-Сити, где он должен вступить в ряды Полицейского департамента. Он опаздывает на свое первое дежурство и спешит поскорее добраться, но когда попадает в город, понимает, что что-то не так — в городе не видно ни одного человека и вокруг царит тишина. Вскоре он встречает девушку по имени Клэр Редфилд, которая приехала в город чтобы найти своего брата, работающего в S.T.A.R.S. Вместе они отправляются на поиски по ходу дела пытаясь выяснить что же происходит в городе...

Выжившие после катастрофы в особняке Спенсера отстраняются от этого дела в связи с «их некомпетентностью», как об это твердят газеты. Только сами выжившие знают, что за всем происшедшим стоит «Амбрелла», но никаких доказательств у них нет. Таинственный помощник Трент подкидывает им информацию о еще одной лаборатории «Амбреллы», в которой можно достать улики. За уликами в лабораторию, находящуюся в бухте Калибан отправляется команда друга Барри Бертона вместе с Ребеккой Чемберз. Но их план дает трещину...

В лесах, расположенных около городка под названием Раккун-Сити происходит серия жестоких убийств, жертвами которых становятся как женщины, так и дети. Убийцы не оставили никаких улик, кроме растерзанных на части трупов. И пока местная полиция теряется в догадках, специальный отдел тактики и спасения (S.T.A.R.S.) посылает в лес две своих команды для поиска улик и самих убийц. Но члены отрядов даже не представляют, с чем они на самом деле столкнулись...